Choroba i wyniki kliniczne u pacjentów z Ebolą w Sierra Leone AD 2

Tutaj przedstawiamy dostępne dane dotyczące pierwszych 106 pacjentów, u których zdiagnozowano EVD, gdy choroba rozprzestrzeniła się na Sierra Leone, aby zapewnić podstawę do zrozumienia choroby klinicznej. Metody
Pacjenci
Przed wykryciem EVD w Sierra Leone pacjenci zostali skierowani do szpitala Kenema Government Hospital w celu przeprowadzenia badań i leczenia, jeśli mieli chorobę spełniającą definicję podejrzewanego przypadku Lassa.11 Po wykryciu pierwszych przypadków EVD pacjenci zostali skierowani, jeśli przedstawiono chorobę, która spełniała definicję przypadku Światowej Organizacji Zdrowia dla EVD.13
Zbieranie danych
Wszystkie kliniczne i laboratoryjne formularze do zbierania danych były używane w szpitalu Kenema Government Hospital w celu leczenia pacjentów z wirusową gorączką krwotoczną przed epidemią EVD. Ponadto wprowadzono protokół pobierania krwi w celu uzyskania próbek, jeśli uznał to za stosowny lekarz prowadzący, od wszystkich pacjentów przyjętych na oddział. Dane demograficzne, kliniczne i dane dotyczące leczenia rejestrowano na standardowych formularzach, które utrzymywano poza oddziałem, a następnie łączono i analizowano po zwolnieniu wszystkich pacjentów w tej kohorcie.
Analiza metaboliczna
Próbki surowicy analizowano za pomocą biochemicznego analizatora krwi Piccolo i kompleksowych dysków z odczynnikami metabolicznymi (Abaxis), zgodnie z zaleceniami producenta. Przeprowadzono pomiary metaboliczne, które obejmowały poziomy sodu, potasu, całkowitego dwutlenku węgla, chlorków, glukozy, wapnia, azotu mocznikowego we krwi, kreatyniny, fosfatazy alkalicznej, aminotransferazy alaninowej (ALT), aminotransferazy asparaginianowej (AST), bilirubiny całkowitej, albuminy i totalna proteina.
EBOV Diagnostics, Viral Load i Genomics
Próbki pobraliśmy przy użyciu protokołów zbiórki i przetwarzania w szpitalu rządowym w Kenema zgodnie z wytycznymi ratownictwa medycznego ustanowionymi przez Ministerstwo Zdrowia i Sanitaryzacji Sierra Leone. Testy diagnostyczne na obecność EBOV przeprowadzono na miejscu za pomocą ilościowych testów odwrotnej transkryptazy-reakcji łańcuchowej polimerazy (RT-PCR) z zastosowaniem jednoetapowego systemu RT-PCR SuperScript III z Platinum Taq DNA Polymerase ( Life Technologies). RNA EBOV oznaczono ilościowo za pomocą ilościowego testu RT-PCR Power SYBR Green RNA-to-CT 1-Step (Life Technologies) na Uniwersytecie Harvarda, jak opisano poprzednio.5 Stężenia amplikonu przekształcono w kopie EBOV na mililitr w celu oceny ilościowej. Sekwencjonowaliśmy zestaw 99 izolatów EBOV uzyskanych od 78 pacjentów i porównaliśmy wyniki ze wszystkimi opublikowanymi sekwencjami EBOV, jak opisano poprzednio.5 (Wszystkie dane dotyczące sekwencji są dostępne w National Center for Biotechnology Information [NCBI BioGroup, PRJNA257197].)
Przegląd Etyki i Bezpieczeństwa Biologicznego
Instytucjonalna komisja rewizyjna na Tulane University, komisja etyczna Uniwersytetu Harvarda oraz komitet ds. Oceny etycznej i recenzji naukowej w Sierra Leone zatwierdziły ten projekt. Komitety te zniosły wymóg uzyskania świadomej zgody podczas epidemii wirusa Ebola w Afryce Zachodniej. Wszystkie próbki kliniczne i dane zostały zebrane w celu rutynowej opieki nad pacjentem i interwencji w zakresie zdrowia publicznego. Instytucjonalne komitety ds. Bezpieczeństwa biologicznego w Tulane i Harvard oraz Komitet ds. Przeglądu Etyki i Naukowego w Sierra Leone dokonały przeglądu i zatwierdzenia protokołów bezpieczeństwa biologicznego dla tego badania.
Analiza statystyczna
Wielokrotne zestawy danych reprezentujące wyniki testu EVD, mapy medyczne pacjentów i wyniki metaboliczne zostały powiązane, aby ograniczyć próbkę do pacjentów, którzy mieli obserwacje z wynikami testu EVD. Wyniki analiz opisowych przedstawiono jako częstotliwości, proporcje i średnie arytmetyczne oraz mediany. Użyliśmy dokładnego testu Fishera do analizy hipotez dotyczących zmiennych dychotomicznych. W przypadkach, w których zmienna kategoryczna była oparta na więcej niż dwóch kategoriach, użyliśmy zwykłej regresji logistycznej, aby dokonać wielokrotnych porównań. Hipotezy obejmujące zmienne ciągłe badano za pomocą podejścia Kruskala-Wallisa. Przeprowadziliśmy nieparametryczne porównania wielokrotne dla zmiennych ciągłych odpowiedzi przez modelowanie ich uporządkowanych według rang wartości danych względem zmiennej kategorycznej sklasyfikowanej według grup porównawczych. Testy hipotezy były dwustronne, z wartością P mniejszą niż 0,05 wskazującą istotność statystyczną. Ze względu na obserwacyjny charakter danych i liczne testy, które zostały wykonane, wszystkie wartości P powinny być interpretowane ostrożnie. Analizy statystyczne przeprowadzono przy użyciu oprogramowania SAS, wersja 9.3 (SAS Institute).
Wyniki
Pacjenci
W sumie 213 pacjentów, którzy mieli chorobę, która spełniała definicję podejrzenia gorączki krwotocznej Lassa lub EVD, zostało przetestowanych między 25 maja a 18 czerwca 2014 r. Za pomocą konwencjonalnej RT-PCR (ryc.
[przypisy: asumin, łokieć golfisty, dinoprost ]

Powiązane tematy z artykułem: asumin dinoprost łokieć golfisty